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PATENTS, PAPERS, CONFERENCES

At LPIXEL, nothing excites us more than using the most advanced technology to bring innovation to the world of research, and to support the development of the next creative study in the life sciences.

PATENTS

Patent Number 4688954
CARTA: Active learning software for automatic classification of biomedical images

RESEARCH PUBLICATIONS

2019
  • Quantitative evaluation of stromule frequency at hourly intervals in Arabidopsis stomatal guard cell chloroplasts.
    Author
    Shimahara Y, Kutsuna N, Hasezawa S, Kojo KH
    Journal
    Cytologia 84(1) 31-35.
  • Identification of cryptochrome inhibitor using phenotype-based chemical genetics.
    Author
    Okubo-Kurihara E, Kutsuna N, Kurihara Y, Matsui M
    Journal
    BSJ Review doi: 10.24480/bsj-review.10b2.00155
  • IMACEL: A cloud-based bioimage analysis platform for morphological analysis and image classification
    Author
    Yuki Shimahara, Ko Sugawara, Kei H. Kojo, Hiroki Kawai, Yuya Yoshida, Seiichiro Hasezawa, Natsumaro Kutsuna
    Journal
    PLOS ONE DOI:10.1371/journal.pone.0212619
2018
  • Deep Learning for MR Angiography: Automated Detection of Cerebral Aneurysms
    Author
    Daiju Ueda, Akira Yamamoto, Masataka Nishimori, Taro Shimono, Satoshi Doishita, Akitoshi Shimazaki, Yutaka Katayama, Shinya Fukumoto, Choppin Antoine, Yuki Shimahara, Yukio Miki
    Journal
    Radiology DOI: 10.1148/radiol.2018180901
  • ROSA26 reporter mouse lines and image analyses reveal the distinct region-specific cell behaviors in the visceral endoderm.
    Author
    Abe T, Kutsuna N, Kiyonari H, Furuta Y, Fujimori T
    Journal
    Development 145 dev165852
  • Ultrafast confocal fluorescence microscopy beyond the fluorescence lifetime limit
    Author
    Mikami H, Harmon J, Kobayashi H, Hamad S, Wang Y, Iwata O, Suzuki K, Ito T, Aisaka Y, Kutsuna N, Nagasawa K, Watarai H, Ozeki Y, Goda K
    Journal
    Optica 5 (2): 117-126
  • Stemness and anti-cancer drug resistance in ABCG2 highly expressed pancreatic cancer is induced on 3D-culture condition
    Author
    Norihiko S, Toshiyuki I, Fumio H, Masaki M, Hiroki K, Yoko M, Tomio A, Naoshi I, Junko A, Kaiyo T, Masashi T
    Journal
    Cancer Science DOI: 10.1111/cas.13533
  • Isolation of uracil auxotroph mutants of coral symbiont alga for symbiosis studies
    Author
    Ishii Y, Maruyama S, Fujimura-Kamada K, Kutsuna N, Takahashi S, Kawata M, Minagawa J
    Journal
    Scientific Reports DOI: 10.1038/s41598-018-21499-3
  • 研究画像不正自動検出システム – 研究画像不正防止に向けた教育活動及びシステム対策「LP-exam Pro2.0」 -
    Author
    湖城 恵
    Journal
    画像ラボ 29: 28-33
2017
  • 人工知能を活用した医療画像診断支援
    Author
    島原 佑基, 小林正明
    Journal
    月刊 新医療 2017年9月号
  • 人工知能を活用した医療画像診断支援システムの効率的な開発
    Author
    島原 佑基, 朽名 夏麿
    Journal
    放射線科情報ポータル(株式会社メディカルアイ) Rad Fan 2017年8月号 Vol 15 No.9
  • 深層学習を活用した脳動脈瘤検知ソフトウェアの開発
    Author
    島原 佑基
    Journal
    医用画像情報学会雑誌 Vol.34 No.2
  • 定量的画像解析により、細胞の中身を知る
    Author
    朽名 夏麿, 馳澤 盛一郎
    Journal
    生体の科学 68: 468-469
  • Modification of growth anisotropy and cortical microtubule dynamics in Arabidopsis hypocotyls grown under microgravity conditions in space
    Author
    Soga K, Yamazaki C, Kamada M, Tanigawa N, Kasahara H, Yano S, Kojo Kei H, Kutsuna N, Kato T, Hashimoto T, Kotake T, Wakabayashi K, Hoson T
    Journal
    Phyiol Plant. DOI: 10.1111/ppl.12640
  • Label-free detection of aggregated platelets in blood by machine-learning-aided optofluidic time-stretch microscopy
    Author
    Jiang Y, Lei C, Yasumoto A, Kobayashi H, Aisaka Y, Ito T, Guo B, Nitta N, Kutsuna N, Ozeki Y, Nakagawa A, Yatomi Y, Goda K
    Journal
    Lab on a Chip 17: 2426-2434
  • ブドウ挿し木苗および幼苗へのブドウ黒とう病菌噴霧接種による抵抗性評価法の開発
    Author
    河野 淳, 朽名 夏麿, 尾上 典之, 伴 雄介, 佐藤 明彦
    Journal
    園芸学研究 16: 391-400
  • 医師と対話して腕を磨く画像診断AI
    Author
    朽名 夏麿, 島原 佑基, 馳澤 盛一郎
    Journal
    実験医学別冊「あなたのラボに人工知能×ロボットがやってくる」夏目徹編 pp62-72
  • FIT: statistical modeling tool for transcriptome dynamics under fluctuating field conditions
    Author
    Iwayama K, Aisaka Y, Kutsuna N, Nagano AJ
    Journal
    Bioinformatics. 33: 1672-1680
  • Exogenous cellulase switches cell interdigitation to cell elongation in a RIC1-dependent manner in Arabidopsis thaliana cotyledon pavement cells
    Author
    Higaki T, Takigawa-Imamura H, Akita K, Kutsuna N, Kobayashi R, Hasezawa S, Miura T
    Journal
    Plant Cell Physiology 58(1): 106-119
  • Cell wall accumulation of fluorescent proteins derived from a trans-Golgi cisternal membrane marker and paramural bodies in interdigitated Arabidopsis leaf epidermal cells
    Author
    Akita K, Kobayashi M, Sato M, Kutsuna N, Ueda T, Toyooka K, Nagata N, Hasezawa S, Higaki T
    Journal
    Protoplasma 254: 367-377
2016
  • In vivo 3D analysis of systemic effects after local heavy-ion beam irradiation in an animal model
    Author
    Nagata K, Hashimoto C, Watanabe-Asaka T, Itoh K, Yasuda T, Ohta K, Oonishi H, Igarashi K, Suzuki M, Funayama T, Kobayashi Y, Nishimaki T, Katsumura T, Oota H, Ogawa M, Oga A, Ikemoto K, Itoh H, Kutsuna N, Oda S, Mitani H
    Journal
    Scientific Reports 6: 28691
  • 公開プラグインを用いた画像解析: LPX プラグイン集 in “ImageJ ではじめる生物画像解析” (三浦耕太, 塚田佑基 編著)
    Author
    朽名 夏麿
    Journal
    学研メディカル秀潤社 129-203
  • Detection of image manipulation and plagiarism in life science research
    Author
    Shimahara Y, Kutsuna N
    Journal
    Editorial Office News (The official publication of the International Society of Managing and Technical Editors) 9: 16-19
  • A theoretical model of jigsaw-puzzle pattern formation by plant leaf epidermal cells
    Author
    Higaki T, Kutsuna N, Akita K, Takigawa-Imamura H, Yoshimura K, Miura T
    Journal
    PLOS Computational Biology 12(4): e1004833
  • Dopamine regulates body size in Caenorhabditis elegans
    Author
    Nagashima T, Oami E, Kutsuna N, Ishiura S, Suo S
    Journal
    Dev Biol. 412: 128-138
2015
  • バイオ画像自動分類ソフトウェア CARTA の開発
    Author
    朽名 夏麿
    Journal
    生物工学会誌 93: 760-761
  • 生命科学研究における画像不正の検出 – LP-exam シリーズの開発と展開 -
    Author
    朽名 夏麿, 島原 佑基, 馳澤 盛一郎
    Journal
    画像ラボ 26: 33-38
  • バイオイメージング分野における画像の自動分類
    Author
    朽名 夏麿
    Journal
    Medical Imaging Technology 33: 105-111
  • Differential responses to high- and low-dose ultraviolet-B stress in tobacco Bright Yellow-2 cells
    Author
    Takahashi S, Kojo KH, Kutsuna N, Endo M, Toki S, Isoda H, Hasezawa S
    Journal
    Frontiers in Plant Science 6: 254
  • A high molecular mass zinc transporter MTP12 forms a functional heteromeric complex with MTP5 in the Golgi in Arabidopsis thaliana
    Author
    Fujiwara T, Kawachi M, Sato Y, Mori H, Kutsuna N, Hasezawa S, Maeshima M
    Journal
    FEBS J 282: 1965-1979
  • Quantitative analysis of microtubule orientation in interdigitated leaf pavement cells
    Author
    Akita K, Higaki T, Kutsuna N, Hasezawa S
    Journal
    Plant Signal Behav 10: e1024396
  • Semi-automatic organelle delection on transmission electon microscopic images
    Author
    Higaki T, Kutsuna N, Akita K, Sato M, Sawaki F, Kobayashi M, Nagata N, Toyooka K, Hasezawa S
    Journal
    Sci Rep 5: 7794
2014
  • 植物細胞のオルガネラのライブイメージングと画像解析
    Author
    朽名 夏麿,長谷川 淳子, 松永幸大
    Journal
    植物の生長調節誌(植物化学調節学会学会誌) 49: 104-111
  • 生物画像解析 — その植物科学研究への関わり —
    Author
    朽名 夏麿
    Journal
    Perceptive Plants NEWS LETTER 2014年8号 12-16
2013
  • Active learning framework with iterative clustering for bioimage classification
    Author
    Natsumaro Kutsuna, Takumi Higaki, Sachihiro Matsunaga, Tomoshi Otsuki, Masayuki Yamaguchi, Hirofumi Fuji, Seiichiro Hasezawa
    Journal
    Nature Communications volume 3, Article number: 1032 (2012)

CONFERECES

2018
  • in natura遺伝子機能 自然変動環境でのフェノーム・トランスクリプトーム・生態学データの機械学習と突然変異体を用いたアプローチ
    Author
    清水 健太郎, Reinhold Stockenhuber, 秋山 玲子, Nicolas Tissot, Michele Wyler, Alex Widmer, Roman Ulm, 孫 建強, 瀬々 潤, 清水(稲継) 理恵, 爲重 才覚, 登内 亜弥, 朽名 夏麿, 田中 健太, 工藤 洋, 佐藤 安弘, 永野 惇, 山崎 絵理, Roman Briskine, 西山 智明, 久米 朋宣, 清水 加耶, 浅野 郁, 市岡 孝朗, 永井 信, 山﨑 美紗子
    Conferences
    第41回日本分子生物学会年会
  • ディープラーニングを用いた3次元電子顕微鏡画像のセミオートセグメンテーション
    Author
    河合 宏紀, 平林 祐介, 朽名 夏麿
    Conferences
    第91回日本生化学会大会
  • 研究者のための画像処理 ‒画像不正を疑われない画像処理‒
    Author
    湖城 恵
    Conferences
    第40回日本生物学的精神医学会・第61回日本神経化学会大会合同年会
  • The Detection and Differential Diagnosis of Colonic Lesions with an Artificial Intelligence Algorithm
    Author
    Kamba Shunsuke, Horiuchi Hideka, Oh Kouki, Fukuda Akihiro, Aya Tonouchi, Kutsuna Natsumaro, Sumiyama Kazuki
    Conferences
    Digestive Disease Week (DDW) 2018
  • Evolution of exon-intron boundary recognition in coral symbiotic algae
    Author
    Maruyama S, Ishii Y, Fujimura-Kamada K, Kutsuna N, Takahashi S, Makino T, Minagawa J, Kawata M
    Conferences
    The Society for Molecular Biology & Evolution 2018
  • 医療画像特に脳動脈瘤検出における人工知能活用について
    Author
    緒方 剛
    Conferences
    第37回日本医用画像工学会大会
  • Mutant coral symbiont alga Symbiodinium opens up a way for switching symbiosis on and off
    Author
    Ishii Y, Murayama S, Fujimura-Kamada K, Kutsuna N, Takahashi S, Kawai M
    Conferences
    第45回内藤コンファレンス
  • Enteroendocrine peptides can regulate insect feeding behavior via controlling intestinal contraction
    Author
    Matsumoto S, Kutsuna N, Nagata S
    Conferences
    アジア・オセアニア比較内分泌学会
  • 三次元画像処理技術を用いた、細胞解析支援ソフトウェアの開発
    Author
    登内 亜弥, 小川 兼司, 望月 優輝, 島原 佑基, 朽名 夏麿
    Conferences
    日本顕微鏡学会第74回学術講演会
  • 人工知能アルゴリズムを用いた非拡大観察における大腸病変の検出および鑑別診断
    Author
    樺 俊介, 堀内 英華,王 光輝, 福田 明広, 登内 亜弥, 島原 佑基, 朽名 夏麿, 炭山 和毅
    Conferences
    第95回日本消化器内視鏡学会総会
  • Development and Validation of Deep Learning Algorithms for Detecting Cerebral Aneurysms in MR angiography
    Author
    Daiju Ueda, Akira Yamamoto, Masataka Nishimori, Taro Shimono, Satoshi Doishita, Akitoshi Shimazaki, Shinichi Tsutsumi, Shinya Fukumoto, Choppin Antoine, Yuki Shimahara, Yukio Miki
    Conferences
    The 77th Annual Meeting of the Japan Radiological Society
  • 人工知能を活用した医療画像診断支援システムの開発
    Author
    島原 佑基
    Conferences
    日本医工学治療学会第34回学術大会
  • 人工知能技術がもたらす医療・生命科学分野の革命
    Author
    島原 佑基
    Conferences
    第26回バイオフィジオロジー研究会
  • 農業応用に向けた機械学習・画像解析技術の開発
    Author
    朽名 夏麿
    Conferences
    第12回バイオイメージングフォーラム
  • AIによる画像解析:植物科学への応用
    Author
    朽名 夏麿
    Conferences
    日本農芸科学会2018年度大会
  • 人工知能(AI)を活用した医療画像診断支援技術 EIRL(エイル)
    Author
    ロメロ・デニス
    Conferences
    AOCR2018(第17回アジア放射線医学学会
  • 医用画像分野におけるAIの活用
    Author
    木田 智士
    Conferences
    医用画像情報学会平成30年度秋季(第182回)大会
  • AIによる画像解析: 植物科学への応用
    Author
    朽名 夏麿, 島原 佑基, 馳澤 盛一郎
    Conferences
    日本農芸化学会2018年度大会
2017
  • AI Medical Image Diagnostic Support System
    Author
    島原 佑基, ショパン・アントワン
    Conferences
    RSNA2017(第103回北米放射線学会)
  • 人工知能を活用したライフサイエンス研究者向けクラウド型画像解析プラットフォーム開発
    Author
    菅原 皓
    Conferences
    薬物動態談話会第40年会
  • 人工知能を活用したライフサイエンス研究者向けクラウド型画像解析プラットフォーム開発
    Author
    菅原 皓
    Conferences
    CBI学会2017年大会
  • 放射線治療領域における画像処理研究の可能性と未来
    Author
    木田 智士
    Conferences
    第45回日本放射線技術学会秋季学術大会
  • 宇宙の微小重力環境におけるシロイヌナズナ胚軸の成長と表層微小管動態 – Aniso Tubule 宇宙実験
    Author
    曽我 康一, 山崎 千秋, 鎌田 源司, 谷川 直樹, 笠原 春夫, 矢野 幸子, 湖城 恵, 朽名 夏麿, 加藤 壮英, 橋本 隆, 小竹 敬久, 若林 和幸, 保尊 隆享
    Conferences
    日本植物学会第81回大会
  • 人工知能を活用したクラウド型画像解析プラットフォーム IMACEL
    Author
    朽名 夏麿
    Conferences
    日本植物学会第81回大会
  • 生物画像自動分類を用いたシロイヌナズナ色素体におけるストロミュールの検出
    Author
    島原 佑基, 湖城 恵, 馳澤 盛一郎, 朽名 夏麿
    Conferences
    日本植物学会第81回大会
  • 非標識リアルタイムイメージング装置を用いた血小板凝集塊の検出法の確立
    Author
    安本 篤史, Yiyue Jiang, Cheng Lei, 相坂 有理, 伊藤 卓朗, Baoshan Guo, 小林 博文, 新田 尚, 朽名 夏麿, 小関 泰之, 中川 敦寛, 合田 圭介, 矢冨 裕
    Conferences
    第39回日本血栓止血学会学術集会
  • 子葉表皮細胞壁の湾曲における微小管結合タンパク質RIC1の役割: 細胞形態計測と力学モデルによる解析
    Author
    桧垣 匠, 今村(滝川) 寿子, 秋田 佳恵, 朽名 夏麿, 三浦 岳, 馳澤 盛一郎
    Conferences
    第58回日本植物生理学会年会
  • 生物画像の自動評価工程をハイスループット化する能動学習技術 CARTA
    Author
    朽名 夏麿
    Conferences
    定量生物学の会 第8回年会
2016
  • 植物表皮細胞の湾曲構造形成のメカニズム
    Author
    三浦 岳, 桧垣 匠, 朽名 夏麿, 秋田 佳恵, 今村(滝川) 寿子, 吉村 賢二
    Conferences
    第39回日本分子生物学会年会
  • 着床後マウス胚における細胞系譜解析
    Author
    阿部 高也, 朽名 夏麿, 清成 寛, 古田 泰秀, 藤森 俊彦
    Conferences
    第39回日本分子生物学会年会
  • マウス着床後初期胚における細胞系譜解析
    Author
    Abe T, Kutsuna N, Kiyonari H, Furuta Y, Fujimori T
    Conferences
    日本発生生物学会大会 秋季シンポジウム2016
  • Radiomics 入門: 機械学習の基礎
    Author
    朽名 夏麿
    Conferences
    第44回 日本磁気共鳴医学会大会
  • Mechanism of jigsaw-puzzle pattern formation in plant leaf epidermal cell: modeling single cell shape by interface equation and convolution kernel
    Author
    Miura T, Higaki T, Akita K, Kutsuna N, Takigawa-Imamura H
    Conferences
    The 2016 (26th) annual meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology
  • 生物・医用画像の自動評価のための能動的機械学習法 CARTA
    Author
    朽名 夏麿
    Conferences
    第20回 NMR マイクロイメージング研究会
  • ポプラにおいて表層微小管の空間構造を制御する転写因子の機能解析
    Author
    高田 直樹, 谷口 亨, 朽名 夏麿
    Conferences
    第66会日本木材学会大会
2015
  • 広域TEM像取得法を用いたシロイヌナズナ茎頂における気温変化に伴うオルガネラ異常の解析
    Author
    澤木 史江, 小林 恵, 盛一 伸子, 佐藤 繭子, 朽名 夏麿, 豊岡 公徳, 永田 典子
    Conferences
    日本植物学会第79回大会
  • 暗所発芽シロイヌナズナ子葉におけるエチオプラストから葉緑体に至る色素体形態変化
    Author
    楠瀬 祥子, 小林 恵, 澤木 史江, 佐藤 繭子, 桧垣 匠, 朽名 夏麿, 豊岡 公徳, 永田 典子
    Conferences
    日本植物学会第79回大会
  • シロイヌナズナ葉表皮細胞における細胞壁湾曲機構の解析
    Author
    桧垣 匠, 今村 寿子, 秋田 佳恵, 朽名 夏麿, 馳澤 盛一郎, 三浦 岳
    Conferences
    日本植物学会第79回大会
  • BY-2細胞における表層微小管配向再形成過程の画像定量解析
    Author
    佐野 行己, <>b朽名 夏麿, 馳澤 盛一郎
    Conferences
    日本植物学会第79回大会
  • 顕微鏡画像群の網羅的解析のためのクラスタリング法の開発
    Author
    朽名 夏麿, 馳澤 盛一郎
    Conferences
    日本植物学会第79回大会
  • Construction of an Arabidopsis electron microscopy atlas
    Author
    Kiminori Toyooka, Mayuko Sato, Mayumi Wakazaki, Kei Hashimoto, Megumi Kobayashi, Fumie Sawaki, Natsumaro Kutsuna, Noriko Nagata
    Conferences
    International Conference on Aabidopsis Research (ICAR)
  • Screening for regulatory factors that control a microtubule structure in hybrid aspen
    Author
    Naoki Takata, Toru Taniguchi, Natsumaro Kutsuna
    Conferences
    Tree Biotechnology Conference 2015
  • 「シロイヌナズナ電顕アトラス」の構築
    Author
    豊岡 公徳, 佐藤 繭子, 若崎 眞由美, 橋本 恵, 小林 恵, 澤木 史江, 朽名 夏麿, 永田 典子
    Conferences
    日本顕微鏡学会 第71回学術講演会
  • ランダム森を用いた顕微鏡画像からのフェノーム解析システムの開発
    Author
    朽名 夏麿, 馳澤 盛一郎
    Conferences
    第56回日本植物生理学会年会
  • RNA 分解酵素 DCP は選択的 RNA 代謝を通じて高温耐性に寄与する
    Author
    元村 一基, Quy Le Thi Nhat, 倉田 哲也, 朽名 夏麿, 真野 昌二, 西村 幹夫, 濱田 隆宏, 渡邊 雄一郎
    Conferences
    第56回日本植物生理学会年会
  • Chemical phenomics for biomass engineering
    Author
    栗原(大窪) 恵美子, 栗原 志夫, 大谷 美沙都, 朽名 夏麿, 永田 典子, 小林 恵, 小松 功典, 菊池 淳, 掛川 弘一, Ong WenDee, 出村 拓, 松井 南
    Conferences
    第56回日本植物生理学会年会
  • 対数増殖期および定常状態期におけるタバコ培養細胞内オルガネラの超微形態変化
    Author
    豊岡 公徳, 佐藤 繭子, 若崎 眞由美, 朽名 夏麿, 永田 典子, 松岡 健
    Conferences
    第56回日本植物生理学会年会
2014
  • Challenge to organellomics by the transmission electron microscopy
    Author
    Nagata N, Kato A, Sawaki F, Kobayashi M, Sato M, Higaki T, Kutsuna N, Hasezawa S, Myouga F, Toyooka K
    Conferences
    The 2nd International Symposium on Plant Environmental Sensing
  • 植物科学研究者にとって画像解析とは何か.JST CREST・さきがけ「二酸化炭素資源化を目指した植物の物質生産力強化と生産物活用のための基盤技術の創出」研究領域ワークショップ
    Author
    朽名 夏麿
    Conferences
    データ科学の発展と植物科学との融合
  • イネの生長過程を定量化するための多角的撮影と画像解析法の開発
    Author
    朽名 夏麿, 川田 亮太, 杉田(小西) 左江子, 馳澤 盛一郎
    Conferences
    日本植物学会第78回大会
  • 植物個体の立体情報の取得のための多角的撮影・再構成法の開発
    Author
    朽名 夏麿, 川田 亮太, 杉田(小西) 左江子, 馳澤 盛一郎
    Conferences
    日本植物形態学会第26回総会・大会

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